药剂科是集药学服务、教学、科研与药事管理为一体的药学专业技术部门，主要承担药品供应与调剂、处方审核与处方点评、个体化药学服务、药品安全性监测、药学会诊与用药咨询、药学信息服务、静脉药物集中配置等专业技术服务和药事管理工作。目前科室共有员工69人，其中主任药师1人，副主任药师1人；博士研究生8人，硕士研究生13人；安徽省首届卫生健康杰出人才1人，安徽省卫生健康委第五周期学术技术带头人（青年领军人才）1人，安徽省肿瘤医院青年技术骨干1人，安徽省肿瘤医院青蓝工程青年骨干人才4人。

科室设置有药品供应、药品调剂、临床药学、药学信息、质量监控5大系统，由门急诊药房、中药房、住院药房、手术药房、静脉用药调配中心、药库、临床药学室、药学实验室、药学质控室、药学信息室等10个部门；配备有全自动发药机、全自动药品分包机、全自动摆药机、意大利APOTECA配药机器人、智能成品输液分拣机、智能贴签机、全自动血药浓度生化分析仪、高效液相色谱仪等仪器设备。科室现为国家抗肿瘤药物临床应用监测网成员单位、国家药品不良反应监测系统网络单位、全国抗菌药物临床应用监测网成员单位、全国合理用药监测网成员单位。

近5年，科室立项课题共21项，其中国家自然科学基金面上项目1项，国家自然科学基金青年科学基金项目2项，省部级课题5项，市厅级课题2项，“科大新医学”联合基金培育项目5项，院内青年科学基金项目6项；主持制订安徽省地方标准2项；以第一作者或通讯作者发表学术论文60余篇，其中发表SCI收录论文20余篇。现有安徽中医药大学硕士生导师1人，中国科学技术大学博士后合作导师1人；承担安徽医科大学临床药理学本科生的理论课教学任务，承担蚌埠医科大学、皖南医学院、阜阳职业技术学院等学校实习生带教任务，每年接受实习生十余名；

科室始终贯彻“以药为器，用心服务”的理念，以医院7个临床肿瘤专病治疗中心为基础，创新肿瘤药学服务模式，重点围绕肿瘤个体化药学、肿瘤营养、肿瘤疼痛、肿瘤抗凝等4个专业方向，打造肿瘤特色药学服务。近年来科室先后荣获“全国抗肿瘤药物临床应用监测网数据质量优秀单位”、“CACA肿瘤临床用药科普优秀集体”、“中共安徽省卫健委直属机关委员会先进基层党组织”、“安徽省卫健委首批基层党建工作领航计划示范支部”、“安徽省审方药师职业技能竞赛团体一等奖”、“安徽省抗癌协会优秀团体”、 “合肥市医疗机构不良反应监测工作先进单位”等荣誉。